CRG标准化了COVID-19数据分析以协助国际研究工作
2020-04-02 16:38:01基因组调控中心(CRG)的研究人员已经启动了一个新数据库，以推进研究COVID-19的国际研究工作。
“科学家正在昼夜不停地了解SARS-CoV-2(引起COVID-19的病毒)，以便我们发现它的弱点并加以击败。全世界大量的科学数据正在发表，” Eva说。 Novoa是巴塞罗那CRG的研究员。
“但是，我们用于研究SARS-CoV-2的某些技术(例如纳米孔RNA测序)太新了，由于所使用的不同标准和方法的拼凑，一篇论文的结果无法与另一篇论文相提并论。我们正在收集所有这些数据并进行分析，以使其达到更具普遍性的可比标准。这将有助于研究人员更快速，准确地发现冠状病毒的优缺点。”
为了了解冠状病毒如何生长，突变和复制，科学家必须对COVID-19的RNA进行测序。RNA序列揭示了有关病毒制造的蛋白质入侵人类细胞并复制的重要信息，这反过来又向政府通报了大流行的传染性和严重性。
传统的测序工具可能需要很长时间才能提供结果。近年来，由于纳米孔测序技术的使用，实时测序数据已成为现实，彻底改变了基因组学研究和疾病暴发监测。纳米孔测序为科学家和临床医生提供了即时，实时访问任何活细胞的DNA和RNA序列信息的功能，从而能够对大流行的威胁做出快速反应。
但是，纳米孔测序产生的原始数据非常复杂。目前，科学家和临床医生缺乏对数据进行可重复分析的系统指南，从而限制了新兴技术的巨大潜力。
为了标准化对公开可用的SARS-CoV-2纳米孔测序数据的分析，巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的研究人员使用了由Eva Novoa和CRG生物信息学小组开发的计算机程序MasterOfPores。该软件于上周在《遗传学的前沿》中首次描述。
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